Прилеп и Пелагонискиот регион има богата традиција на производство на тутун која датира од 1873 година, кога е основан првиот склад за набавка и преработка на тутун. Регионот стана познат по производството на висококвалитетен ориенатален тутун, особено познатите сорти Прилеп и Јака.
Во 1930 година, хрватскиот научник Рудолф Горник воведе нови сорти тутун, што означи почеток на златната ера на производството на тутун во Прилеп. За време на Југославијата, владата основа државна тутунска компанија во 1949 година, која играше клучна улога во меѓународната трговија, извезувајќи тутун во Соединетите Држави, Јапонија и Европа. Првата фабрика за цигари во Прилеп е основана во 1955 година, дополнително зајакнувајќи ја репутацијата на градот во индустријата за тутун. Преку годините, тутунскиот сектор на Прилеп се разви, со соработки со големи брендови како Philip Morris International.
Музејот на тутунот во Прилеп е скриена драгоценост која ја прикажува богатата историја на културата на тутунот. Се наоѓа во рамките на Научниот институт за тутун, музејот поседува импресивна колекција на труби, кутија за цигари, кутија за снаф, и чибуци, некои направени од злато, сребро, жолчна коска и коска од носорог. Со над 2,000 експонати, вклучувајќи ретки артефакти од Европа, Азија и Северна Африка, тој е еден од најединствените музеји на тутун во Балканот. Посетителите можат да го истражуваат уметничкото и историјата значење на тутунот преку уметнички изработени предмети, некои кои потекнуваат од 18-тиот и 19-тиот век.
Тутунот во Прилеп и денес останува клучен дел од локалната економија што во просек годишно се произведуваат 27.000 тони тутун на скоро 14.000 хектари површина и околу 17.000 семејства се занимаваат со тутун од кој 65% од нив доаѓаат од Прилеп и околината.
